Den nationella strategin, som regeringen tog beslut om i december 2006, är en långsiktig satsning på att stärka regionernas konkurrenskraft med ett ökat entreprenörskap. Genom att bl.a. fokusera på företagens förutsättningar, behovet av att öka antalet företag, öka tillgängligheten i ett glestbefolkat land samt genom att lyfta fram samarbete över nationsgränser vill regeringen stödja regionerna att svara upp mot de utmaningar de i dag står inför men även att tillvarata de möjligheter som erbjuds dem. Prioriterade områden i strategin är Innovativa miljöer och Förnyelse, Kompetensförsörjning och Ökat arbetskraftsutbud, Tillgänglighet och Gränsöverskridande samarbete. Regeringen betonar även det regionala politiska inflytandes betydelse i arbetet med att genomföra den nationella strategin och de regionala strukturfondsprogrammen.

Programmen har utarbetats inom åtta programområden; Övre Norrland, Norra Mellansverige, Mellersta Norrland, Stockholm, Östra Mellansverige, Västsverige, Sydsverige, och Småland och öarna.